按照教育部統一部署，自2013年起，清華大學定點幫扶云南省大理州南澗彝族自治縣。啟動定點幫扶工作以來，學校高度重視、傾情投入，從提升南澗縣干部行政能力、提高當地基礎教育能力和醫療衛生水平、促進當地特色農業產業轉型升級等方面實施精準幫扶，取得明顯成效。截至2018年底，南澗縣貧困發生率從2013年底的28.05%降至1.32%，成功實現提前一年達到脫貧摘帽標準。2019年4月，南澗縣正式退出貧困縣序列。

堅持黨建引領，夯實扶貧之“基”。學校黨委統一領導定點扶貧工作，書記主抓、分管校領導主責、班子成員按照分工共同推動。把定點扶貧工作納入學校事業發展規劃，制定年度工作計劃并定期召開專題會議研究部署推進。成立定點扶貧工作辦公室，牽頭協調落實各項工作。先后選派6名青年骨干教師在南澗縣接力掛職，開展幫扶工作。劃撥專項經費100萬元，支持南澗縣“基層黨建提升年”和黨建扶貧“雙推進”提升工程。與南澗縣聯合舉辦“學習貫徹十九大精神，堅決打贏脫貧攻堅戰”活動，深入南澗基層進行巡回宣講9場，參訓人員1200余人。協調清華控股捐贈100萬元，重點打造西山村、團山村、新山村3個黨建示范點。清華控股黨委結對幫扶南澗縣西山村黨總支，支持西山村的黨組織建設，推動基礎設施改善和集體經濟發展。

堅持特色幫扶，提升扶貧之“效”。在南澗縣設立清華大學教育扶貧遠程教學站，培訓黨政干部1700余人次，專業技術人員2000余人次。在校內開設南澗縣黨政干部和骨干教師培訓班，培訓黨政干部240余人次，骨干教師220余人次。成立互聯網學校，為南澗縣1800位教師和2.5萬名中小學生免費提供優質在線課程。依托清華附中，在南澗設立清華附中創新實驗班，包括初中2個班、高中2個班，共120人；培訓南澗縣骨干教師450余人次。每年在南澗縣開展兒童先天性心臟病救治工作，并拓展到大理州全部12縣市及周邊部分縣。累計開展7次先心病篩查活動，篩查疑似患者2151名，確診717名，減免掛號、檢查費用近70萬元。引入慈善基金700多萬元，支持21個批次的503名患兒在學校第一附屬醫院完成手術。

堅持創新發展，增強脫貧之“能”。設立“清華大學南澗縣綠色食品基地”，集中采購南澗特色農產品300余萬元。協調清華控股下屬企業投入資金3000余萬元，在南澗注冊成立茶葉、烏骨雞龍頭企業，助力當地普洱茶、烏骨雞產業升級。兩家企業直接幫助20余名建檔立卡貧困戶就業，促進1500余戶貧困戶增收。加強清華控股所屬企業云南子公司與南澗縣合作，發起成立南澗產業扶貧基金，募集資金2000萬元。組織20多個學生實踐支隊到南澗縣開展支教、實踐、咨詢服務等活動，如美術學院“藝術點亮鄉村”實踐支隊4次到南澗，持續為南澗縣和特色產業進行形象及產品設計。